除铁锰过滤器的主要功能是去除水中的铁和锰离子，但其在处理过程中也展现出对细菌有一定的去除效果，不过这种效果相对有限且不是其主要设计目标。
在处理含铁（锰）的地下水时，水中的铁（锰）离子在氧化后流经锰砂滤层，滤层中的接触氧化反应、滤料表面的生物化学作用以及物理截留和吸附作用共同促使水中的铁（锰）离子得以沉淀并被去除。这一过程中，由于滤料的粗糙表面和过滤作用，可能会同时去除部分细菌。此外，在处理微污染的含锰地下水时，铁细菌能够高效地去除铁锰，同时以水中的氨为营养源进行新陈代谢，与其他细菌协同作用，进一步去除水中的氨氮，这也间接说明了除铁锰过滤器在处理过程中对细菌有一定的去除能力。
然而，需要注意的是，除铁锰过滤器并不是专门的消毒设备。如果水中细菌含量较高或需要高度消毒，应使用专门的消毒设备或工艺进行处理。此外，除铁锰过滤器的去除细菌效果还取决于其设计、操作条件以及维护状况等因素。
除铁锰过滤器在处理过程中能够去除部分细菌，但其主要功能是去除水中的铁和锰离子。对于需要去除水中细菌的场合，应优先考虑使用专门的消毒设备或工艺。
